Είναι γνωστό ότι η αξιοπιστία της εξέτασης αίματος εμβρυϊκού DNA επηρεάζεται από το ποσοστό του εμβρυϊκού DNA στο αίμα της εγκύου.
Ένα πολύ χαμηλό ποσοστό εμβρυϊκού DNA κινδυνεύει να μην μπορεί να ανιχνεύσει μια χρωμοσωμική ανωμαλία και να δώσει ένα ψευδώς αρνητικό αποτέλεσμα.
Το ποσοστό του εμβρυϊκού DNA στο αίμα της εγκύου τείνει να είναι χαμηλότερο σε γυναίκες με μεγάλο δείκτη μάζας σώματος (ΔΜΣ- >30).
Επίσης, στις περιπτώσεις που υπάρχουν Τρισωμίες 18, 13 ή Τριπλοειδία, το εμβρυϊκό DNA είναι αισθητά χαμηλότερο σε σχέση με άλλες κυήσεις.
Ακόμη και η φαρμακευτική αγωγή μπορεί να επηρεάσει αρνητικά τα ποσοστά του εμβρυϊκού DNA.
Γι’ αυτό , το ποσοστό του εμβρυϊκού DNA υπολογίζεται σε κάθε δείγμα εξέτασης και αναφέρεται, ώστε σε περίπτωση που το εμβρυϊκό DNA είναι πολύ χαμηλό, η εξέταση να επαναλαμβάνεται αργότερα στην κύηση.
